В период с 2023-2025 гг. университет реализовывал проекты, охватывающие широкий спектр дисциплин. В университете проводится работа с Российским научным фондом (РНФ). В 2025 г. инициативными группами ученых были поданы заявки в РНФ, из них  были поддержаны - 5 проектов.

В 2025 году продолжает реализовываться проект Яковийчука А.В. «Антиоксидантная и фотосинтетическая система различных экологических групп микроводорослей как маркер биотехнологического потенциала в условиях фотоиндукции», первый проект университета, получивший финансирование в РНФ. 

Участие в  государственных программах подтверждает востребованность исследований МелГУ в контексте Стратегии научно-технологического развития Российской Федерации (Утверждена Указом Президента Российской Федерации от 28 февраля 2024 г. № 145) и определенных в ней приоритетов научно-технологического развития, Стратегии социально-экономического развития Запорожской области.

Таким образом, МелГУ позиционирует себя как научный центр, где сочетание фундаментальных и прикладных исследований, междисциплинарный подход и ориентация на государственные задачи обеспечивают вклад в науку, образование, общественное благополучие и социально-экономическое развитие Запорожского региона. Это укрепляет репутацию университета как значимого участника в инновационной экосистеме страны.

Исследования проводятся по кодам, отражающим как узкоспециализированные, так и межотраслевые направления:

Естественные науки:

1. Экология (1.6.19),
2. Орнитология (1.6.13).

Сельскохозяйственные и биотехнологические науки:

1. Садоводство и виноградарство (4.1.5),
2. Сельскохозяйственная биотехнология (4.4.1),
3. Сельскохозяйственные науки (4.1.1).

Технические и инженерные направления:

1. Строительная инженерия (2.1.3),
2. Электротехника и электроника (2.2.1),
3. Прикладная механика (2.3.2).

Социально-гуманитарные науки:

1. Экономика (5.2.1),
2. Политология (5.6.1),
3. История (6.1.1).

Образование и педагогика:

1. Общее образование,
2. педагогика, дидактика (5.3.1).

Такое разнообразие направлений подчеркивает междисциплинарный подход, способствующий комплексному решению научных и социальных задач.

 Лучшие 6 проектов студенческой молодежи реализовывались с помощью поддержки Фонда содействия инноваций «Студенческий Стартап»:

1. Создание технологического оборудования для распылительной сушки.
2. Жидкая пленка для защиты поверхностей от механических повреждений, прямых солнечных лучей и ультрафиолета. 
3. Разработка технологии французской выпечки с черешней» путем создания мини-пекарни на территории ФГБОУ ВО МелГУ. 
4. Разработка профилактически-оздоровительных продуктов питания (хлебцев) на основе проросших зерен. 
5. Создание серии детских книг «Медовый край». 
6. Поэтическая АЗБУКА-ПАЗЛ Запорожской области для дошкольников и школьников младших классов.

Исследования по экологии и орнитологии способствуют сохранению биоразнообразия. Проводимые исследования усилены кооперацией с ИКИ РАН, что позволяет ученым МелГУ изучать данные и проводить исследования с помощью космического зондирования Земли.

Работы в садоводстве и сельскохозяйственных науках ориентированы на повышение эффективности АПК. Одним из новых направлений, подготовленных учеными в 2025 году, является тема «Создание высокотехнологичного селекционно-питомниководческого комплекса для совершенствования сортимента плодовых культур, снижения уровня импортозависимости и устойчивого роста производства плодовой продукции юга России». Проект поддержан в рамках нового Национального проекта России «Технологическое обеспечение продовольственной безопасности». 

Значимым для развития данной научной сферы является проект "Высокотехнологичный селекционно-питомниководческий комплекс плодовых культур Новороссии", который выиграл в Конкурсе на предоставление субсидий из федерального бюджета в целях создания и внедрения в АПК современных технологий на основе собственных разработок научных и образовательных организаций в 2025 г.